La Fundación Rómulo Raggio se crea el 30/08/1961, poco tiempo después del fallecimiento de Rómulo. Según su estatuto, su objeto es promover en toda forma posible la investigación científica y tecnológica, las artes, las letras y la cultura en todas sus manifestaciones y posibilidades.
Así funcionaron en el edificio laboratorios de investigación y una importante biblioteca de agronomía, biología, química y ciencias afines. El 30/08/1983, 107 aniversario del nacimiento de Rómulo, se inauguró en el hoy llamado Palacio Lorenzo Raggio el Museo de la Fundación Rómulo Raggio.
La Fundación, entidad civil privada sin fines de lucro, con personería jurídica desde 1963, es propietaria del inmueble, donado por Miguel Mario Raggio (Rosario, Sta. Fe 1926, único hijo de Rómulo).

 La Fundación cuenta con reducido capital operativo. Los fondos con que lleva a cabo su obra provienen de cuatro fuentes principales:
1. Bonos contribución por entrada a las exposiciones de su colección de arte argentino; muestras de arte y artesanías, conciertos, espectáculos, congresos, cursos de capacitación, seminarios, presentaciones de libros, etc.
2. Cuotas de los alumnos de sus más de cincuenta talleres y cursos sobre los temas más variados;
3. Suscripción a la revista  Φyton
4. Apoyo privado, individual y de empresas.

Gobierna la Fundación El Consejo de Administración:

El Palacio Lorenzo Raggio, núcleo del Centro Cultural y destacado exponente arquitectónico del neoclasicismo ecléctico, ha sido declarado de interés municipal. En la Cámara de Diputados de la Nación se ha propuesto declararlo "Patrimonio Cultural de Interés Nacional". Cada año, por ordenanzas del Concejo Deliberante, se lo exime del pago de impuestos y tasas municipales. La Provincia lo exime del impuesto inmobiliario. Se gestionan reducciones en las tarifas de agua, gas, electricidad y teléfono.
En la fundación funciona la Biblioteca de Arte "Horacio Ruiz Pombo", y otra de Humanidades y Ciencia en general. En 1976 la Fundación donó una valiosa colección de revistas científicas que perteneciera a Miguel Mario Raggio, a la Universidad Nacional de Comahue, donde ayudó a formar la "Biblioteca Rómulo Raggio" de la Facultad de Ciencias Agrarias, en Cinco Saltos (Río Negro). Al Instituto de Botánica del Nordeste, en la ciudad de Corrientes, le donó libros de la especialidad. La Fundación promueve la presentación en el exterior de jóvenes artistas argentinos y gestiona el intercambio con artistas extranjeros. Realiza también muestras itinerantes.
A partir de 1961, la Fundación toma a su cargo la publicación y distribución mundial de ØYTON, Revista Internacional de Botánica Experimental (fundada en 1951), órgano de la Sociedad Latinoamericana de Fisiología Vegetal. El canje con más de 200 publicaciones nacionales y extranjeras se dona a la Biblioteca Rómulo Raggio (Comahue).
Subsidia ocasionalmente la publicación de artículos en ØYTON.
La Fundación otorga la Medalla "Rómulo Raggio" al Mérito por Propulsar la Cultura Argentina y becas en distintas áreas.